本报讯 美国密歇根年夜学安娜堡分校的微生物学家Paul Jensen想看看人工智能东西，是否用来综合剖析差别微生物的研讨结果。于是他找到了与本人研讨的远缘链球菌相干的全体论文，但统共才有多少十篇。现实上，很多微生物学家面对着相似的窘境，乃至更糟。克日，Jensen在bioRxiv上颁布了一项研讨结果，发明仅10种细菌就占了全部论文的一半，而近3/4已定名的细菌居然不一篇专门研讨它们的论文。“人们只具体研讨了多数多少种细菌。”Jensen表现，“但更多细菌，尤其是对人类安康跟地球情况至关主要的微生物，现在特殊缺少研讨。”像其余性命迷信家一样，微生物学家也会研讨形式生物，盼望从像年夜肠杆菌如许被充足研讨的试验室“骄子”中取得实用于其余生物的看法。为了量化微生物学范畴对多数形式生物的“偏幸”，Jensen查阅了一个包括43409种奇特细菌的数据库，并统计了美国当局经营的生物医学文献库PubMed索引的论文数目。这些论文会在题目或择要中提到细菌的称号。不出不测，年夜肠杆菌以超越31.2万篇论文名列榜首，占总数的21%。前10名中的其余细菌有金黄色葡萄球菌、结核分枝杆菌跟幽门螺旋杆菌等。但是，有74%的已知细菌在任何论文的题目或择要中都不被说起。从前25年里，已知细菌与被研讨的细菌之间的差距越来越年夜，局部起因是研讨职员对微生物停止了年夜范围测序，一直扩大微生物名录。意年夜利特伦托年夜学的Nicola Segata对研讨成果倍感懊丧，但并不惊奇。除了一两个破例，大批存在于安康人类微生物组中的细菌并不进入50种最佳研讨细菌名单。Segata等人发明的很多对人类安康至关主要的微生物乃至未被定名，更不必说研讨了。“另有很长的路要走，才干到达应有的研讨程度。”Segata表现。美国得克萨斯年夜学奥斯汀分校的Brett Baker指出，在大陆跟泥土等多种生态体系中发明的微生物同样未失掉充足研讨。“天然界的很多重要生物都不在这个名单上，这是一个成绩。”研讨职员表现，改正细菌的宣布偏向并非易事，但要想从微生物组研讨中获益，就必需如许做。此中一个挑衅就是在试验室中培养未被充足研讨的微生物。“年夜肠杆菌之以是风行，局部起因是它轻易成长，很多取得充足研讨的微生物都存在这种特征。”Baker说。Jensen悲观地以为，迷信家能够进修培养主要但研讨缺乏的微生物。在Baker看来，微生物学家能够从年夜天然中吸取灵感，研讨试验室培养的微生物混杂物。“这些货色每每不肯意单独生活。”大批尽力兴许能弥补空缺。加拿年夜非营利构造“开放迷信”的名目司理Shantal Al Habib表现，该机构的“向翻新看齐”名目刚启动了一项耗资100万美元的任务，旨在描写1000种微生物在1000种差别前提下的成长特色，详细包含差别养分状态、氧气程度跟温度等。“开放迷信”位于美国旧金山的迷信名目担任人Pete Kelly弥补说，这些数据将收费供给给迷信家，辅助练习人工智能模子，以进一步深刻懂得微生物。Jensen加入了“向翻新看齐”名目。他以为，如许做的目标并不是让微生物学家废弃年夜肠杆菌等形式生物，转而研讨更独特的物种。“假如咱们持续以同样的方法研讨微生物学，那么要花1万年才干很好地懂得全部差别的微生物。”（赵宇彤）相干论文信息：https://doi.org/ 10.1101/2025.01.04.631297